Столкнулся с такой ошибкой в свежеустановленной FreeBSD системе.
При при попытке найти файл с помощью locate мне выдало ошибку:
# locate port
locate: database too small: /var/db/locate.database
Решается это очень просто:
/usr/libexec/locate.updatedb
или добавляем задачу в крон:
/etc/periodic/weekly/310.locate